まちがって都会(とかい)にやってきた森に住むアルビン、サイモン、セオドアのシマリス３兄弟。やっとの思いでたどりついたのは作曲家デイブの家。１人と３匹、まるで家族のような新しい生活がはじまりました。そんなある日(ひ)、デイブの曲をアルビンたちが歌ったら、いままで売れなかった曲は大ヒット！３兄弟はたちまち大スターに！！
でもレコード会社のたくらみによって、１人と３匹の仲はバラバラにされてしまいます。何もかもが手に入るようになったけど、いそがしいばかり。そんな毎日の中で、やがてアルビンたちは “いちばん大切なもの”に気がつき、楽しかったデイブとの生活に戻りたくなってきました。もう一度、みんなは一緒にくらせるの･･･？