時代は明治に入り都は東京に移るという変革期に、さまざまな近代化政策のひとつとして、日本で最初の学区制小学校が京都に創設された。明治2年(1869年)のことである。
上京区、下京区の地域を64の学区に分けた番組小学校(当時の町域の区分であった「番組（町組）」を単位として創設された小学校)が京都の企業、町衆がお金を出し合い創られた。それは京都が江戸時代から漢学・国学・洋学や町人の道徳哲学である心学などの私塾や寺子屋の伝統が築かれていたため、国より先立つ学校制度が創られたのである。
平成の時代に入り、京都市の中心部の小学校は、少子化の影響で生徒数が激減したため、いくつかの小学校を統合されることとなった。この機会に学校の成り立ち、歩みを公開しようと考えられたのがこの博物館である。
明治創設から平成の統合にかけて、京都の教育と学校の歴史を，教科書，教具・教材や古文書などの歴史資料により展示するとともに，学校ゆかりの作家から母校に寄贈された美術工芸品等（学校文化財）を展示する全国に例を見ない施設である。懐かしい小学校の思い出がここに来れば甦るかもしれない。
※この博物館は、平成４年、統合で廃校になった元京都市立開智小学校を改装して使用している。『下京区御幸町通仏光寺下がる』

【アクセス：市バス、四条河原町下車、徒歩10分】